Der Garten ist mit zahlreichen Institutionen vernetzt. Dazu zählen nicht nur andere Botanische Gärten, sondern auch Forschungseinrichtungen, globale Dachverbände, Vereine und viele mehr.

• Arbeitsgemeinschaft Österreichischer Botanischer Gärten
• BGCI - The world's largest plant conservation network
• Department für Botanik und Biodiversitätsforschung
• Fakultät für Lebenswissenschaften
• International Agenda for Botanic Gardens in Conservation
• International Association of Botanic Gardens (IABG)
• Kompetenzzentrum für Didaktik der Biologie
• Science Center Netzwerk
• Verband Botanischer Gärten e.V.
• Wiener Schule der Botanischen Illustration