Mit großen Wasserflächen ist der Botanische Garten nicht gesegnet, aber es befinden sich immerhin acht Wasserbecken und kleinere künstliche Teiche auf dem öffentlichen Gelände, die allesamt interessante Pflanzen beherbergen und interessante Aspekte vermitteln und einen Besuch wert sind.

Von ehemals 10 historischen Wasserbecken einer formal-barocken Gartengesamtgestaltung aus dem beginnenden 19. Jahrhundert sind fünf noch heute existent, wobei nur jenes im Host'schen Garten in Gruppe 41 noch komplett mit originalem Randstein erhalten ist. Dieses Wasserbecken ist gleichzeitig barockes, historisches Zitat und Zäsur in der neuesten und modernsten Schaugruppe und Forschungssammlung des Botanischen Gartens. Eingebettet in die so genannte Pannonische Gruppe nahe den Steppenpflanzungen über Sand und Silikat gedeiht in diesem Wasserbecken die einheimische Gelbe Teichmummel (Nuphar lutea).

Von besonderer Bedeutung ist das größte Wasserbecken des Botanischen Gartens der Universität Wien, welches sich in der Gruppe 19 befindet. Dieses ovale Becken markiert seit seiner Entstehung zu Beginn des 19. Jahrhunderts das Zentrum des Botanischen Gartens. Neugestaltungen der umliegenden Flächen greifen immer wieder die zentrale Lage auf und überhöhen diese. Mit 9 Pflanzringelementen in 45 Teilen (siehe historisches Foto) bot dieses Becken in den 1930er Jahren exzellente Möglichkeiten zur Schau und Kultur von Wasser- und Sumpfpflanzen für den akademischen Lehrbetrieb im Institut für Botanik und zur Information der Bevölkerung. In den 1970er Jahren schlug das Becken leck und musste trocken gelegt werden. Seit Jahren gibt es seitens des Botanischen Gartens der Universität Wien, der Universität Wien und der Bundesimmobiliengesellschaft (BIG) große Anstrengungen, das Wasserbecken baldmöglichst zu sanieren und wieder seiner ursprünglichen Funktion zuzuführen.

Ausgesuchte Besonderheiten der anderen Wasserbecken und Teiche:

• Historisches Becken Gruppe 4: Seerosensorten und Gewöhnlicher Froschlöffel (Alisma plantago-aquatica)
• Historisches Becken Gruppe 14: Indische Lotosblume (Nelumbo nucifera)
• Teich und Wasserlauf in Gruppe 37: Sommer-Knotenblume (Leucojum aestivum) - sommerblühende große Verwandte des Märzenbechers (Leucojum vernum), selten bzw. stark gefährdet
• Sumpfbecken Gruppe 46: Drachenwurz (Calla palustris) - einheimisches vom Aussterben bedrohtes Aronstabgewächs mit auffälligem weißen Hochblatt

Pflanzenporträts und Infoblätter zu dieser Schaugruppe

• Nelumbo nucifera - Indische Lotosblume